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L’irrigation permet de faciliter l’instrumentation grâce à sa capacité de lubrification, d’éliminer les débris, de dissoudre les composants organiques infectés et de désinfecter le système endodontique grâce à son effet bactéricide. Dentiste utilise différentes substances d'irrigation qui cherchent à éliminer le tissu pulpaire, la boue dentinaire et un biofilm restant des zones non touchées par l'instrument. L'hypochlorite de sodium dans ses différentes concentrations ainsi que la chlorhexidine sont des irrigants très étudiés quant à leur susceptibilité à l'élimination du biofilm.
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